2026/03/07 更新

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スズキ ヒロミ
鈴木 博実
SUZUKI HIROMI
所属
学部 農学部 専任准教授
職名
専任准教授
通称等の別名
鈴木 博実
外部リンク

学位

  • 理学博士

研究分野

  • ライフサイエンス / 生物物理学  / 生物物理学(Biophysics)

  • ライフサイエンス / 分子生物学  / 分子生物学(Molecular Biology)

学歴

  • 東京理科大学   理工学研究科   応用生物科学

    1985年4月 - 1988年3月

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    国・地域: 日本国

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  • 東京理科大学   理工学研究科

    1983年4月 - 1985年3月

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    国・地域: 日本国

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  • 東京理科大学   理学部   物理

    1979年4月 - 1983年3月

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    国・地域: 日本国

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所属学協会

論文

  • シアノバクテリアにおけるトリカルボン酸回路由来のリンゴ酸は主にリンゴ酸デヒドロゲナーゼではなく、マリック酵素によって酸化される 査読

    13 ( 6 )   2022年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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  • 統計的手法を用いた逆平行および平行βsheet中でのstrand ペア形成予測法の開発

    竹本 周二

    明治大学農学部研究報告   56 ( 4 )   209-227 - 227   2007年3月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:明治大学  

    アミノ酸配列に基づくタンパク質の立体構造予測法の開発は,実用面からも知的探究心を満たすという面からも大いに注目されている研究課題の1つである。既に2次構造領域の予測精度は75%に達しており,この2次構造のパッキング予測方法の開発が進められている。このパッキング過程における重要なステップの1つとしてβstrandの会合によるβsheet形成がある。本研究では,既知のタンパク質立体構造データに基づいて,水素結合形成の有無を考慮したβstrand間での残基ペアの出現頻度より統計的スコアを算出した。このスコアを用いてstrandペアに対して正確な位置から前後8残基の範囲で移動させながらstrand配置関係予測を行ったところ,その検出精度は逆平行ペアに対しては38%,平行ペアに対しては35%であった。統計的に算出したスコアに2次構造予測から得られたスコアを加えた場合には,それぞれ40%および38%に上昇した。Strandトリプレットに対して,左右のstrandの位置を固定して中央のstrandを正確な位置から前後8残基の範囲で移動させた場合の検出精度は50%,2次構造予測から得られたスコアを加えた場合には52%となった。正確な位置から前後1および2残基のずれとして予測された割合はいずれの場合も5%以上存在し,βstrand領域の全残基に対する2次構造予測としてみた精度はstrandペアでは68%,strandトリプレットでは80%に達し,用いた2次構造予測法による精度58%を大幅に上回った。このように今回開発した方法は,βstrandの会合予測だけではなく,βstrand領域予測に対しても有効であり,タンパク質の立体構造予測への貢献が十分期待できる。

    CiNii Research

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    その他リンク: http://agriknowledge.affrc.go.jp/RN/2010740743

  • 遺伝的アルゴリズムを用いた edge strand とcentral strand の判別法の開発

    鈴木博実

    明治大学農学部研究報告   55 ( 4 )   (159-168)   2006年3月

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    記述言語:日本語  

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  • 遺伝子配置に基づいた環状2本鎖ゲノム間距離の推定法の開発

    松永友英, 鈴木博実

    明治大学農学部研究報告   ( 139 )   (1-13)   2004年9月

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    記述言語:日本語  

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  • A procedure for Detecting Similarity between Distantly Related Protein-Families

    H. Suzuki, S. Fukuchi, K. Horimoto

    In Begehr, H.G.W., Gilbert, R.P. and Kajiwara, J.(eds)Proceedings of Second International Congress ISAAC   2   1275-1283   2000年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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  • A bacteriophage T4 DNA/Protein sequence database available on the WWW

    H.Suzuki, F. Arisaka, E. Kutter, E. Thomas, A. Tsugita, T. Kunisawa

    Res. Commum. Biochem. Cell&Molec. Biol.   2   309-322   1998年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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  • 学生の実態を考慮した農学における情報教育

    私立大学情報教育協会私情教ジャーナル   5 ( 4 )   18-19   1997年3月

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    記述言語:日本語  

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  • ゲノム情報ワークショップでのワークステーション発表「An attempt to integrate various database using an object-oriented database management system 」

    1994年12月

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    記述言語:日本語  

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  • Protein variant database:data interchangeable with the protein sequence database and nonsequence database

    A.Ubasawa, H.Suzuki, N.Miyatake, F.Okibayashi, L.Lunjiang, K.Imai, K.Satake, A.Tsugita

    1993年5月

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    記述言語:英語  

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  • Protein variant database:data interchangeable with the protein sequence database and nonsequence database

    A.Ubasawa*, H.Suzuki, N.Miyatake*, F.Okibayashi*, L.Lunjiang*, K.Imai*, K.Satake*, A.Tsugita*

    Prot. Engineer. Springer-Verlag   6   1026   1993年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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  • 蛋白質DB検索システム「TOPIQUS」

    鈴木博実, 岩崎正秀*, 加藤博章*

    情報の科学と技術   42 ( 10 )   954-956 - 956   1992年

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:一般社団法人 情報科学技術協会  

    DOI: 10.18919/jkg.42.10_954

    CiNii Research

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  • Principal Component Analysis to Detect the Similarity of Distantly Related Proteins : Its Application to Cytochromes c, c1 and f.

    K.Horimoto*, H.Suzuki, J.Otsuka*

    Protein Sequence & Data Analysis   4   33-42   1991年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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  • A protein secondary structure (PSS) database

    H.Suzuki, A.S.Kolaskas*, S.L.Samuel*, J.Otsuka*, A.Tsugita*

    Springer-VerlagProtein Seq Data Anal.   4   97-104   1991年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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  • Discrimination between adaptive and nuetral amino acid substitutions in vertebrate hemoglobins

    K.Horimoto, H.Suzuki, J.Otsuka

    Springer-VerlagJ. Mol. Evol.   31   302-324   1990年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/BF02101125

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  • 蛋白質のデータベースを活用して生物進化を探る

    堀本勝久*, 鈴木博実, 宮武謙文*, 福地佐斗志*, 大塚仁也*

    『1990情報学シンポジウム講演論文集』   79-88   1990年

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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  • Regulation in the synthesis of Escherichia coli RNA polymerase proposed from sequence analysis

    J.Otsuka*, H.Suzuki, T.Kunisawa*

    Springer-VerlagProtein Sequence & Data Analysis   1   355-361   1988年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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  • Theoretical analysis of single-round transcription experiments on trp leader region

    H.Suzuki, T.Kunisawa, J.Otsuka

    Biophysical SocietyBiophysical Journal   51   407-412   1987年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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  • Theoretical evaluation of transcriptional pausing effect on trp leader sequence

    H.Suzuki, T.Kunisawa, J.Otsuka

    Biophysical SocietyBiophysical Journal   49   425-435   1986年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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書籍等出版物

  • コンピューター環境の整備

    "加藤博章*, 鈴木博実"( 担当: 共著)

    食品化学新聞社食品産業のためのプロテインエンジニアリング  1993年 

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    担当ページ:214-221   記述言語:日本語   著書種別:学術書

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  • コンピュータ活用の現状と動向

    "萩原稔*, 金子寛生*, 高田俊和*, 鈴木博実"( 担当: 共著)

    食品化学新聞社食品産業のためのプロテインエンジニアリング  1992年 

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    担当ページ:307-343   記述言語:日本語   著書種別:学術書

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講演・口頭発表等

  • シート内における隣接ストランド間のCα間距離の解析

    〇鈴木博実

    第59回日本生物物理学会年会  2021年11月  日本生物物理学会

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    開催年月日: 2021年11月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:オンライン開催   国・地域:日本国  

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  • α-トコフェロール輸送タンパク質の進化的起源の探索

    〇矢竹 真, 増澤(尾崎)依, 鈴木 博実, 竹中 麻子

    日本農芸化学会2021年度仙台大会  2021年3月  日本農芸化学会

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    開催年月日: 2021年3月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:宮城県仙台市  

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  • βシート中のジスルフィド結合の効果はタンパク質の置かれた環境に依存している

    第42回日本分子生物学会年会  2019年12月  日本分子生物学会

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

    開催地:福岡国際会議場、福岡サンパレスホテル&ホール、マリンメッセ福岡  

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  • アンチパラレルβシート中のジスルフィド結合が分泌タンパク質フォールディングに及ぼす影響

    第57回生物物理学会年会(2019年度)  2019年9月  日本生物物理学会

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

    開催地:シーガイアコンベンションセンター  

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  • ジスルフィド結合のタンパク質2次構造集合における影響

    第41回日本分子生物学会年会  2018年11月  日本分子生物学会

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

    開催地:Pacifico Yokohama  

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  • ジスルフィド結合はβ-ストランドを逆平行に会合することに関与している?

    第56回日本生物物理学会年会  2018年9月  日本生物物理学会

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

    開催地:岡山大学  

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  • 隣接したβstrand上におけるアミノ酸トリプレットの配置パターン解析

    鈴木博実

    2017年度生命科学系学会合同年次大会  2017年12月  日本分子生物学会、日本生化学会

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

    開催地:神戸  

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  • β-シート中の隣接したstrand上のCys-Cys ペアは好まれる

    鈴木博実

    第55回日本生物物理学会年会  2017年9月  日本生物物理学会

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

    開催地:熊本  

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  • β-ストランド間に存在するαーへリックスはパラレルペア形成だけではなくβ-ストランドペア選択傾向にも影響する

    第39回日本分子生物学会年会  2016年12月  日本分子生物学会

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

    開催地:横浜  

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  • β-シート中におけるアミノ酸トリプレットパターンの解析

    第54回日本生物物理学会年会  2016年11月  日本生物物理学会

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

    開催地:つくば  

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  • β-シート中におけるアミノ酸トリプレットの横並びパターンはアミノ酸残基の組み合わせだけではなく、水素結合形成パターンにおいても明確な傾向を示す

    第38回日本分子生物学会年会第88回日本生化学大会合同大会  2015年12月  日本分子生物学会/日本生化学会

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

    開催地:神戸  

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  • α-へリックスがβ-ストランドペア形成に及ぼす影響

    第53回日本生物物理学会年会  2015年9月  日本生物物理学会

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

    開催地:金沢  

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  • edge strand とcentral strand におけるペア傾向性の違いはβ-sheet 中の strand の並び順に影響を与える

    第37回日本分子生物学会年会  2014年11月  日本分子生物学会

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

    開催地:横浜  

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  • β-sheet 中でのペア傾向はedge strand とcentral strand では全く異なる

    第52回日本生物物理学会年会  2014年9月  日本生物物理学会

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

    開催地:札幌  

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  • edge 領域と central 領域のアミノ酸配列および傾向の違いがβ-sheet 形成予測に対して及ぼす役割

    渡部周平

    第36回日本分子生物学会年会  2013年12月  日本分子生物学会

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • Edge strand と central strand は異なったペアパートナー選択傾向を示す

    日本生物物理学会第51回年会  2013年10月  日本生物物理学会

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • β-sheet 形成予測においてedge strand 識別が持つ役割

    渡部周平

    第35回日本分子生物学会年会  2012年12月  日本分子生物学会

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • どのようにβ-strand はβ-sheet 中でその位置を決めるのか?

    日本生物物理学会第50回年会  2012年9月  日本生物物理学会

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • アミノ酸ペア傾向はβ-strand 配置に対して平行シート中よりも逆平行シート中においてより重要な役割を果たす

    第34回日本分子生物学会年会  2011年12月  日本分子生物学会

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • アミノ酸ペア傾向を用いたβ-sheet 形成予測法の開発(2)

    日本生物物理学会第49回年会  2011年9月  日本生物物理学会

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Role of amino acid pairing propensity on β-sheet formation

    BMB2010 Biochemistry and Molecular Biology  2010年12月 

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • アミノ酸ペア傾向を用いたβ-sheet形成予測法の開発

    第48日本生物物理学会年会  2010年9月  日本生物物理学会

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • βsheet中のstrand配置順決定におけるアミノ酸ペア選択傾向の役割

    田島耕太郎

    第32回日本分子生物学会年会  2009年12月  日本分子生物学会

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • アミノ酸対形成傾向がβシート中でのストランド配置順に与える効果

    第47回日本生物物学会年会  2009年11月  日本生物物理学会

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • βシート形成におけるペア選択傾向の役割

    田島 耕太郎

    第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会 合同大会  2008年12月 

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    記述言語:日本語   会議種別:ポスター発表  

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  • β strand 配置決定における残基ペア選択傾向の役割

    第46回日本生物物理学会年会  2008年12月  日本生物物理学会

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    記述言語:日本語   会議種別:ポスター発表  

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  • 統計学的手法を用いたβstrand 配置予測法の開発

    第45回日本生物物理学会年会  2007年12月 

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    記述言語:日本語   会議種別:ポスター発表  

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  • 統計的手法を用いた逆平行および平行βsheet 中でのstrand ペア形成予測法の開発

    第30回日本分子生物学会年会・第80回に本生化学会大会  2007年12月 

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    記述言語:日本語   会議種別:ポスター発表  

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  • Development of a method classifying edge strands from central strands

    20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology and 11th FAOBMB Congress  2006年6月 

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • βシートの端に位置するβストランドと中央部に位置するβストランドとの識別

    第28回日本分子生物学会年会  2005年12月  日本分子生物学会

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    記述言語:日本語   会議種別:ポスター発表  

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  • Molecular phylogenetic analysis of proteins associated in energy metabolism

    ◎T.Tomiki*, N.Saitou*, H.Suzuki(専任講師)

    2001年11月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • エネルギー代謝に関する蛋白質の分子系統学的解析

    ◎富木毅*, 斉藤成也*, 鈴木博実(専任講師)

    2001年7月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • A procedure for detecting similarity between distantly related protein families

    ◎Hiromi Suzuki(専任講師), Katsuhisa Horimoto*(Saga Medical School・助教授)

    1999年8月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • "大腸菌のべん毛蛋白質FIgB,C,E,F,Gの分子進化"

    "鈴木博実, 猪口款行, 大塚仁也"

    1998年12月 

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    記述言語:日本語   会議種別:ポスター発表  

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  • 出芽酵母SKI2subfamilyヘリカーゼの配列解析及び分子進化

    ◎矢葺幸光*(大学院生), 大塚仁也*(教授), 鈴木博実(専任講師)

    1998年12月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • A Genomic Database of Bacteriophage T4 : Comparison of Codon Usage Preferences in Phage-Host Systems

    "T.Kunisawa, H.Suzuki, F.Arisaka, E.Kutter, A.Tsugita"

    1998年11月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • TOPIQUS a Multidatabase Retrieval System

    15th International CODATA Conference  1996年10月 

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • Protein variant database

    "I. Ubasawa, H. Suzuki, N. Miyatake, F. Okibayashi, L, Lunjiang, K. Imai, K. Satake, A. Tsugita"

    第5回日本蛋白工学会年会  1993年5月 

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    記述言語:日本語   会議種別:ポスター発表  

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  • 蛋白質DB検索システムTOPIQUS」

    鈴木博実, 加藤博章

    ドクメンテーション・シンポジウム  1992年6月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 蛋白質二次構造データベース

    鈴木博実, 大塚仁也, 次田皓

    第2回日本蛋白工学会年会  1990年5月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • アテニュエイション機構による大腸菌ピリミジンde novo 合成オペロンの転写制御

    鈴木博実, 国沢隆, 大塚仁也

    日本生物物理学会第26回年会  1988年10月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • E. coli RNA ポリメラーゼ発現の転写調節について

    鈴木博実, 国沢隆, 大塚仁也

    日本生物物理学会第25回年会  1987年10月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • アテニュエイション機構によるアミノ酸合成オペロンの転写制御

    鈴木博実, 国沢隆, 大塚仁也

    日本生物物理学会第24回年会  1986年10月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • リーダーシークエンスでの転写一時停止のアテニュエイション機構における役割

    鈴木博実, 国沢隆, 大塚仁也

    日本生物物理学会第23回年会  1985年9月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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共同研究・競争的資金等の研究課題

  • 蛋白質の機能と構造

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    資金種別:競争的資金

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  • 転写発現制御機構

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    資金種別:競争的資金

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  • 分子進化

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    資金種別:競争的資金

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