2026/03/31 更新

写真a

オオガネ　ジュン
大鐘　潤
OHGANE JUN
所属
学部 農学部 専任教授
職名
専任教授
外部リンク

学位

  • 博士（農学） （ 1999年3月   東京大学 ）

  • 修士（農学） （ 東京大学 ）

研究キーワード

  • DNAメチル化

  • 非コードRNA

  • エピゲノム改変

  • エピジェネティクス

研究分野

  • 環境・農学 / 遺伝育種科学  / 農学

  • ライフサイエンス / 獣医学  / 畜産学・獣医学

  • ライフサイエンス / 獣医学  / 応用動物科学

  • ライフサイエンス / 遺伝学  / 生物系

学歴

  • 東京大学   農学生命科学研究科   応用動物科学

    1996年4月 - 1999年3月

    　 詳細を見る

    国・地域： 日本国

    researchmap

  • 東京大学   農学生命科学研究科   応用動物科学専攻

    1994年4月 - 1996年3月

    　 詳細を見る

    国・地域： 日本国

    researchmap

  • 東京大学   農学部   農芸化学科

    - 1994年3月

    　 詳細を見る

    国・地域： 日本国

    researchmap

経歴

  • 明治大学農学部生命科学科   教授

    2019年4月 - 現在

    　 詳細を見る

  • 明治大学   准教授

    2014年4月 - 2019年3月

    　 詳細を見る

  • 明治大学   農学部   専任講師

    2011年4月 - 2014年3月

    　 詳細を見る

  • 東京大学大学院   農学生命科学研究科   助教

    1999年8月 - 2011年3月

    　 詳細を見る

  • 日本学術振興会   日本学術振興会特別研究員   特別研究員（PD）

    1999年4月 - 1999年7月

    　 詳細を見る

所属学協会

  • 日本畜産学会

    2016年11月 - 現在

    　 詳細を見る

  • 日本下垂体研究会

    2014年8月 - 現在

    　 詳細を見る

  • 日本農芸化学会

    2011年9月

    　 詳細を見る

  • 日本エピジェネティクス研究会

    2007年4月

    　 詳細を見る

  • 日本繁殖生物学会

    1999年4月 - 現在

    　 詳細を見る

委員歴

  • 日本繁殖生物学会   評議委員  

    2020年4月 - 現在   

    　 詳細を見る

    団体区分：学協会

    researchmap

  • 日本繁殖生物学会   編集委員会  

    2015年4月 - 現在   

    　 詳細を見る

    団体区分：学協会

    researchmap

  • 日本繁殖生物学会   男女共同参画委員会  

    2011年4月 - 現在   

    　 詳細を見る

    団体区分：学協会

    researchmap

論文

  • Epigenome editing-mediated restoration of FBN1 expression by demethylation of CpG island shore in porcine fibroblasts. 国際誌

    Rio Miyadai, Shiori Hinata, Yuya Amemiya, Satori Shigematsu, Kazuhiro Umeyama, Hiroshi Nagashima, Kenji Yamatoya, Jun Ohgane

    Biochemistry and biophysics reports   42   101973 - 101973   2025年6月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    Fibrillin-1, an extracellular matrix protein encoded by the FBN1 gene, is crucial for maintaining connective tissue integrity. Mutations in FBN1 result in haploinsufficiency, leading to Marfan syndrome, in which the expression of functional FBN1 is correlated with disease onset and severity. Recent studies suggest that FBN1 expression is modulated by DNA methylation, particularly within the CpG island shores of its promoter region. In porcine models, FBN1 mRNA levels have been found to correlate with the proportion of hypomethylated alleles in the CpG island shore region. In this study, we employed epigenome editing using the dCas9-TET1 system to induce targeted DNA demethylation within the FBN1 CpG island shore, which became hypermethylated after a prolonged culture of porcine fetal fibroblast cells. This approach effectively reduced methylation in the targeted region, and cells expressing the dCas9-TET1 system maintained hypomethylation across multiple passages. Critically, DNA demethylation of the FBN1 CpG island shore restored FBN1 expression in heterozygous FBN1 knockout fibroblasts, which developed stochastic hypermethylation after extended culture. These findings highlight the potential of DNA methylation manipulation to restore FBN1 expression in cells with a haploinsufficient genetic background.

    DOI： 10.1016/j.bbrep.2025.101973

    PubMed

    researchmap

  • Epigenome editing revealed the role of DNA methylation of T-DMR/CpG island shore on Runx2 transcription. 国際誌

    Yutaro Kawa, Miyuki Shindo, Jun Ohgane, Masafumi Inui

    Biochemistry and biophysics reports   38   101733 - 101733   2024年7月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    RUNX2 is a transcription factor crucial for bone formation. Mutant mice with varying levels of Runx2 expression display dosage-dependent skeletal abnormalities, underscoring the importance of Runx2 dosage control in skeletal formation. RUNX2 activity is regulated by several molecular mechanisms, including epigenetic modification such as DNA methylation. In this study, we investigated whether targeted repressive epigenome editing including hypermethylation to the Runx2-DMR/CpG island shore could influence Runx2 expression using Cas9-based epigenome-editing tools. Through the transient introduction of CRISPRoff-v2.1 and gRNAs targeting Runx2-DMR into MC3T3-E1 cells, we successfully induced hypermethylation of the region and concurrently reduced Runx2 expression during osteoblast differentiation. Although the epigenome editing of Runx2-DMR did not impact the expression of RUNX2 downstream target genes, these results indicate a causal relationship between the epigenetic status of the Runx2-DMR and Runx2 transcription. Additionally, we observed that hypermethylation of the Runx2-DMR persisted for at least 24 days under growth conditions but decreased during osteogenic differentiation, highlighting an endogenous DNA demethylation activity targeting the Runx2-DMR during the differentiation process. In summary, our study underscore the usefulness of the epigenome editing technology to evaluate the function of endogenous genetic elements and revealed that the Runx2-DMR methylation is actively regulated during osteoblast differentiation, subsequently could influence Runx2 expression.

    DOI： 10.1016/j.bbrep.2024.101733

    PubMed

    researchmap

  • Phenotypic features of genetically modified DMD-XKOXWT pigs. 国際誌

    Kazutoshi Okamoto, Hitomi Matsunari, Kazuaki Nakano, Kazuhiro Umeyama, Koki Hasegawa, Ayuko Uchikura, Shuko Takayanagi, Masahito Watanabe, Jun Ohgane, Michael Stirm, Mayuko Kurome, Nikolai Klymiuk, Masaki Nagaya, Eckhard Wolf, Hiroshi Nagashima

    Regenerative therapy   24   451 - 458   2023年12月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    INTRODUCTION: Duchenne muscular dystrophy (DMD) is a hereditary neuromuscular disorder caused by mutation in the dystrophin gene (DMD) on the X chromosome. Female DMD carriers occasionally exhibit symptoms such as muscle weakness and heart failure. Here, we investigated the characteristics and representativeness of female DMD carrier (DMD-XKOXWT) pigs as a suitable disease model. METHODS: In vitro fertilization using sperm from a DMD-XKOY↔XWTXWT chimeric boar yielded DMD-XKOXWT females, which were used to generate F2 and F3 progeny, including DMD-XKOXWT females. F1-F3 piglets were genotyped and subjected to biochemical analysis for blood creatine kinase (CK), aspartate aminotransferase, and lactate dehydrogenase. Skeletal muscle and myocardial tissue were analyzed for the expression of dystrophin and utrophin, as well as for lymphocyte and macrophage infiltration. RESULTS: DMD-XKOXWT pigs exhibited various characteristics common to human DMD carrier patients, namely, asymptomatic hyperCKemia, dystrophin expression patterns in the skeletal and cardiac muscles, histopathological features of skeletal muscle degeneration, myocardial lesions in adulthood, and sporadic death. Pathological abnormalities observed in the skeletal muscles in DMD-XKOXWT pigs point to a frequent incidence of pathological abnormalities in the musculoskeletal tissues of latent DMD carriers. Our findings suggest a higher risk of myocardial abnormalities in DMD carrier women than previously believed. CONCLUSIONS: We demonstrated that DMD-XKOXWT pigs could serve as a suitable large animal model for understanding the pathogenic mechanism in DMD carriers and developing therapies for female DMD carriers.

    DOI： 10.1016/j.reth.2023.09.010

    PubMed

    researchmap

  • Genetically engineered animal models for Marfan syndrome: challenges associated with the generation of pig models for diseases caused by haploinsufficiency.

    Naomi Jack, Tomoyuki Muto, Keigo Iemitsu, Tamaki Watanabe, Kazuhiro Umeyama, Jun Ohgane, Hiroshi Nagashima

    The Journal of reproduction and development   68 ( 4 )   233 - 237   2022年8月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    Recent developments in reproductive biology have enabled the generation of genetically engineered pigs as models for inherited human diseases. Although a variety of such models for monogenic diseases are currently available, reproduction of human diseases caused by haploinsufficiency remains a major challenge. The present study compares the phenotypes of mouse and pig models of Marfan syndrome (MFS), with a special focus on the expressivity and penetrance of associated symptoms. Furthermore, investigation of the gene regulation mechanisms associated with haploinsufficiency will be of immense utility in developing faithful MFS pig models.

    DOI： 10.1262/jrd.2022-027

    PubMed

    researchmap

  • Epigenetic effects of insecticides on early differentiation of mouse embryonic stem cells. 国際誌

    Wenlong Wang, Tomohiro Ito, Satoshi Otsuka, Hiroko Nansai, Kuniya Abe, Yoichi Nakao, Jun Ohgane, Minoru Yoneda, Hideko Sone

    Toxicology in vitro : an international journal published in association with BIBRA   75   105174 - 105174   2021年9月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    Increasing evidence indicates that many insecticides produce significant epigenetic changes during embryogenesis, leading to developmental toxicities. However, the effects of insecticides on DNA methylation status during early development have not been well studied. We developed a novel nuclear phenotypic approach using mouse embryonic stem cells harboring enhanced green fluorescent protein fused with methyl CpG-binding protein to evaluate global DNA methylation changes via high-content imaging analysis. Exposure to imidacloprid, carbaryl, and o,p'-DDT increased the fluorescent intensity of granules in the nuclei, indicating global DNA methylating effects. However, DNA methylation profiling in cell-cycle-related genes, such as Cdkn2a, Dapk1, Cdh1, Mlh1, Timp3, and Rarb, decreased in imidacloprid treatments, suggesting the potential influence of DNA methylation patterns on cell differentiation. We developed a rapid method for evaluating global DNA methylation and used this approach to show that insecticides pose risks of developmental toxicity through DNA methylation.

    DOI： 10.1016/j.tiv.2021.105174

    PubMed

    researchmap

  • DNA methylation ambiguity in the Fibrillin-1 (FBN1) CpG island shore possibly involved in Marfan syndrome. 査読 国際誌

    Sci Rep   10 ( 1 )   5287 - 5287   2020年3月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1038/s41598-020-62127-3

    PubMed

    researchmap

  • Complete chloroplast genome sequence and phylogenetic analysis of wasabi (Eutrema japonicum) and its relatives. 査読 国際誌

    Sci Rep   9 ( 1 )   14377 - 14377   2019年10月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1038/s41598-019-49667-z

    PubMed

    researchmap

  • Evidence of exposure to chemicals and heavy metals during pregnancy in Japanese women 査読

    Ryo Maekawa, Rie Ito, Yusuke Iwasaki, Koichi Saito, Kazuhiko Akutsu, Satoshi Takatori, Rie Ishii, Fumio Kondo, Yoshikazu Arai, Jun Ohgane, Kunio Shiota, Tsunehisa Makino, Norihiro Sugino

    Reproductive Medicine and Biology   16 ( 4 )   337 - 348   2017年10月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：John Wiley and Sons Ltd  

    DOI： 10.1002/rmb2.12049

    Scopus

    PubMed

    researchmap

  • Establishment of DNA methylation patterns of the Fibrillin1 (FBN1) gene in porcine embryos and tissues 査読

    Yoshikazu Arai, Kazuhiro Umeyama, Kenta Takeuchi, Natsumi Okazaki, Naomi Hichiwa, Sayaka Yashima, Kazuaki Nakano, Hiroshi Nagashima, Jun Ohgane

    JOURNAL OF REPRODUCTION AND DEVELOPMENT   63 ( 2 )   157 - 165   2017年4月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1262/jrd.2016-158

    Web of Science

    researchmap

  • Involvement of DNA methylation in regulating rat Prop1 gene expression during pituitary organogenesis. 査読 国際誌

    J Reprod Dev   63 ( 1 )   37 - 44   2017年2月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1262/jrd.2016-102

    Web of Science

    researchmap

  • Ultra-Deep Bisulfite Sequencing to Detect Specific DNA Methylation Patterns of Minor Cell Types in Heterogeneous Cell Populations: An Example of the Pituitary Tissue 査読

    Yoshikazu Arai, Hisho Fukukawa, Takanori Atozi, Shoma Matsumoto, Yutaka Hanazono, Hiroshi Nagashima, Jun Ohgane

    PLOS ONE   11 ( 1 )   e0146498   2016年1月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1371/journal.pone.0146498

    Web of Science

    researchmap

  • An epigenetic regulatory element of the Nodal gene in the mouse and human genomes. 査読 国際誌

    Mech Dev   136   143 - 154   2015年5月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1016/j.mod.2014.12.003.

    Web of Science

    researchmap

  • Putative Epimutagens in Maternal Peripheral and Cord Blood Samples Identified Using Human Induced Pluripotent Stem Cells 査読

    Yoshikazu Arai, Koji Hayakawa, Daisuke Arai, Rie Ito, Yusuke Iwasaki, Koichi Saito, Kazuhiko Akutsu, Satoshi Takatori, Rie Ishii, Rumiko Hayashi, Shun-Ichiro Izumi, Norihiro Sugino, Fumio Kondo, Masakazu Horie, Hiroyuki Nakazawa, Tsunehisa Makino, Mitsuko Hirosawa, Kunio Shiota, Jun Ohgane

    BIOMED RESEARCH INTERNATIONAL   2015 ( 876047 )   2015年

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1155/2015/876047

    Web of Science

    researchmap

  • DNA methylation profiles provide a viable index for porcine pluripotent stem cells 査読

    Yoshikazu Arai, Jun Ohgane, Shuh-Hei Fujishiro, Kazuaki Nakano, Hitomi Matsunari, Masahito Watanabe, Kazuhiro Umeyama, Dai Azuma, Naomi Uchida, Nozomu Sakamoto, Tomohiro Makino, Shintaro Yagi, Kunio Shiota, Yutaka Hanazono, Hiroshi Nagashima

    Genesis   51 ( 11 )   763 - 776   2013年11月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1002/dvg.22423

    Scopus

    PubMed

    researchmap

  • Oocyte-specific linker histone H1foo is an epigenomic modulator that decondenses chromatin and impairs pluripotency 査読

    Koji Hayakawa, Jun Ohgane, Satoshi Tanaka, Shintaro Yagi, Kunio Shiota

    EPIGENETICS   7 ( 9 )   1029 - 1036   2012年9月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.4161/epi.21492

    Web of Science

    researchmap

  • Bridging sequence diversity and tissue-specific expression by DNA methylation in genes of the mouse prolactin superfamily 査読

    Koji Hayakawa, Momo O. Nakanishi, Jun Ohgane, Satoshi Tanaka, Mitsuko Hirosawa, Michael J. Soares, Shintaro Yagi, Kunio Shiota

    MAMMALIAN GENOME   23 ( 5-6 )   336 - 345   2012年6月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1007/s00335-011-9383-x

    Web of Science

    researchmap

  • Disease-dependent differently methylated regions (D-DMRs) of DNA are enriched on the X chromosome in uterine leiomyoma. 査読 国際誌

    J Reprod Dev   Vol. 57 ( 5 )   604 - 612   2011年10月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1262/jrd.11-035A

    Web of Science

    researchmap

  • Epigenetic assessment of environmental chemicals detected in maternal peripheral and cord blood samples 査読

    Yoshikazu Arai, Jun Ohgane, Shintaro Yagi, Rie Ito, Yusuke Iwasaki, Koichi Saito, Kazuhiko Akutsu, Satoshi Takatori, Rie Ishii, Rumiko Hayashi, Shun-Ichiro Izumi, Norihiro Sugino, Fumio Kondo, Masakazu Horie, Hiroyuki Nakazawa, Tsunehisa Makino, Kunio Shiota

    Journal of Reproduction and Development   57 ( 4 )   507 - 517   2011年

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1262/jrd.11-034A

    Scopus

    PubMed

    researchmap

  • Enrichment of short interspersed transposable elements to embryonic stem cell-specific hypomethylated gene regions 査読

    Hiroki Muramoto, Shintaro Yagi, Keiji Hirabayashi, Shinya Sato, Jun Ohgane, Satoshi Tanaka, Kunio Shiota

    GENES TO CELLS   15 ( 8 )   855 - 865   2010年8月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1111/j.1365-2443.2010.01423.x

    Web of Science

    researchmap

  • Genome-wide DNA methylation profile of tissue-dependent and differentially methylated regions (T-DMRs) residing in mouse pluripotent stem cells 査読

    Shinya Sato, Shintaro Yagi, Yoshikazu Arai, Keiji Hirabayashi, Naoko Hattori, Misa Iwatani, Keisuke Okita, Jun Ohgane, Satoshi Tanaka, Teruhiko Wakayama, Shinya Yamanaka, Kunio Shiota

    GENES TO CELLS   15 ( 6 )   607 - 618   2010年6月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1111/j.1365-2443.2010.01404.x

    Web of Science

    researchmap

  • エピジェネティック調節 招待

    高杉征樹,大鐘潤,塩田邦郎

    日本臨床   Vol.68   307 - 312   2010年2月

    　詳細を見る

    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    researchmap

  • Establishment of trophoblast stem cell lines from somatic cell nuclear-transferred embryos 査読

    Mayumi Oda, Satoshi Tanaka, Yukiko Yamazaki, Hiroshi Ohta, Misa Iwatani, Masako Suzuki, Jun Ohgane, Naka Hattori, Ryuzo Yanagimachi, Teruhiko Wakayama, Kunio Shiota

    PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA   106 ( 38 )   16293 - 16297   2009年9月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1073/pnas.0908009106

    Web of Science

    researchmap

  • Neonatal exposure to diethylstilbestrol alters expression of DNA methyltransferases and methylation of genomic DNA in the mouse uterus 査読

    Koji Sato, Hideki Fukata, Yasushi Kogo, Jun Ohgane, Kunio Shiota, Chisato Mori

    Endocrine Journal   56 ( 1 )   131 - 139   2009年

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1507/endocrj.K08E-239

    Scopus

    PubMed

    researchmap

  • Interplay between DNA methylation, histone modification and chromatin remodeling in stem cells and during development 招待 査読

    Kohta Ikegami, Jun Ohgane, Satoshi Tanaka, Shintaro Yagi, Kunio Shiota

    INTERNATIONAL JOURNAL OF DEVELOPMENTAL BIOLOGY   53 ( 2-3 )   203 - 214   2009年

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1387/ijdb.082741ki

    Web of Science

    researchmap

  • DNA methylation profile of tissue-dependent and differentially methylated regions (T-DMRs) in mouse promoter regions demonstrating tissue-specific gene expression 査読

    Shintaro Yagi, Keiji Hirabayashi, Shinya Sato, Wei Li, Yoko Takahashi, Tsutomu Hirakawa, Guoying Wu, Naoko Hattori, Naka Hattori, Jun Ohgane, Satoshi Tanaka, X. Shirley Liu, Kunio Shiota

    GENOME RESEARCH   18 ( 12 )   1969 - 1978   2008年12月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1101/gr.074070.107

    Web of Science

    researchmap

  • Potential link between estrogen receptor-alpha gene hypomethylation and uterine fibroid formation 査読

    Hiromi Asada, Yoshiaki Yamagata, Toshiaki Taketani, Aki Matsuoka, Hiroshi Tamura, Naoko Hattori, Jun Ohgane, Naka Hattori, Kunio Shiota, Norihiro Sugino

    MOLECULAR HUMAN REPRODUCTION   14 ( 9 )   539 - 545   2008年9月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1093/molehr/gan045

    Web of Science

    researchmap

  • Epigenetics: The DNA methylation profile of tissue-dependent and differentially methylated regions in cells 招待 査読

    J. Ohgane, S. Yagi, K. Shiota

    PLACENTA   29   S29 - S35   2008年3月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1016/j.placenta.2007.09.011

    Web of Science

    researchmap

  • Sequential changes in genome-wide DNA methylation status during adipocyte differentiation 査読

    Hideki Sakamoto, Yasushi Kogo, Jun Ohgane, Naka Hattori, Shintaro Yagi, Satoshi Tanaka, Kunio Shiota

    BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS   366 ( 2 )   360 - 366   2008年2月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1016/j.bbrc.2007.11.137

    Web of Science

    researchmap

  • 細胞特異的DNAメチル化プロフィール 招待

    大鐘潤,ほか2名

    蛋白質核酸酵素   Vol.52   2177 - 2182   2007年12月

    　詳細を見る

    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    researchmap

  • DNA methylation errors in cloned mice disappear with advancement of aging 査読

    Sho Senda, Teruhiko Wakayama, Yoshikazu Arai, Yukiko Yamazaki, Jun Ohgane, Satoshi Tanaka, Naka Hattori, Ryuzo Yanagimachi, Kunio Shiota

    Cloning and Stem Cells   9 ( 3 )   293 - 302   2007年9月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1089/clo.2006.0050

    Scopus

    PubMed

    researchmap

  • Epigenetic regulation of Nanog gene in embryonic stem and trophoblast stem cells 査読

    Naoko Hattori, Yuko Imao, Koichiro Nishino, Naka Hattori, Jun Ohgane, Shintaro Yagi, Satoshi Tanaka, Kunio Shiota

    GENES TO CELLS   12 ( 3 )   387 - 396   2007年3月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1111/j.1365-2443.2007.01058.x

    Web of Science

    researchmap

  • Neonatal exposure to diethylstilbestrol alters the expression of DNA methyltransferases and methylation of genomic DNA in the epididymis of mice 査読 国際誌

    Endocr. J   Vol.53 ( No.3 )   331 - 337   2006年6月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1507/endocrj.K06-009

    Web of Science

    researchmap

  • Methylation in embryonic stem cells in vitro 招待 査読 国際誌

    Methods Mol. Biol   Vol.329   421 - 445   2006年2月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    researchmap

  • 発生・分化とエピジェネティクス 招待

    岩谷美沙,大鐘潤,塩田邦郎

    ゲノム医学   Vol.5 ( No.5 )   25 - 30   2005年9月

    　詳細を見る

    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    researchmap

  • Analysis of tissue-specific DNA methylation during development 招待 査読 国際誌

    Methods Mol. Biol   Vol.289   371 - 382   2004年10月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    researchmap

  • Non-coding RNA directed DNA demethylation of Sphk1 CpG island 査読

    T Imamura, S Yamamoto, J Ohgane, N Hattori, S Tanaka, K Shiota

    BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS   322 ( 2 )   593 - 600   2004年9月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1016/j.bbrc.2004.07.159

    Web of Science

    researchmap

  • Skewed X-inactivation in cloned mice 査読

    S Senda, T Wakayama, Y Yamazaki, J Ohgane, N Hattori, S Tanaka, R Yanagimachi, K Shiota

    BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS   321 ( 1 )   38 - 44   2004年8月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1016/j.bbrc.2004.06.096

    Web of Science

    researchmap

  • Different molecular mechanisms underlie placental overgrowth phenotypes caused by interspecies hybridization, cloning, and Esx1 mutation 査読

    U Singh, LE Fohn, T Wakayama, J Ohgane, C Steinhoff, B Lipkowitz, R Schulz, A Orth, HH Ropers, RR Behringer, S Tanaka, K Shiota, R Yanagimachi, UA Nuber, R Fundele

    DEVELOPMENTAL DYNAMICS   230 ( 1 )   149 - 164   2004年5月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1002/dvdy.20024

    Web of Science

    researchmap

  • Epigenetic control of mouse Oct-4 gene expression in embryonic stem cells and trophoblast stem cells 査読

    N Hattori, K Nishino, YG Ko, N Hattori, J Ohgane, S Tanaka, K Shiota

    JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY   279 ( 17 )   17063 - 17069   2004年4月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1074/jbc.M309002200

    Web of Science

    researchmap

  • The Sall3 locus is an epigenetic hotspot of aberrant DNA methylation associated with placentomegaly of cloned mice 査読

    J Ohgane, T Wakayama, S Senda, Y Yamazaki, K Inoue, A Ogura, J Marh, S Tanaka, R Yanagimachi, K Shiota

    GENES TO CELLS   9 ( 3 )   253 - 260   2004年3月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1111/j.1365-2443.2004.00720.x

    Web of Science

    researchmap

  • Genome-wide analysis of DNA methylation status of CpG islands in embryoid bodies, teratomas, and fetuses 査読

    M Kremenskoy, Y Kremenska, J Ohgane, N Hattori, S Tanaka, K Hashizume, K Shiota

    BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS   311 ( 4 )   884 - 890   2003年11月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1016/j.bbrc.2003.10.078

    Web of Science

    researchmap

  • DNAメチル化からみたほ乳類ゲノムの進化とクローン動物 招待

    高畑尚之,中込弥男,森脇和郎,大鐘潤,塩田邦郎

    生物の科学 遺伝 別冊No15「遺伝学はゲノム情報でどう変わるか」   ( No15 )   2002年11月

    　詳細を見る

    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    researchmap

  • Epigenetic marks by DNA methylation specific to stem, germ and somatic cells in mice 査読

    K Shiota, Y Kogo, J Ohgane, T Imamura, A Urano, K Nishino, S Tanaka, N Hattori

    GENES TO CELLS   7 ( 9 )   961 - 969   2002年9月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1046/j.1365-2443.2002.00574.x

    Web of Science

    researchmap

  • Differentiation of trophoblast lineage is associated with DNA methylation and demethylation 査読

    J Ohgane, N Hattori, M Oda, S Tanaka, K Shiota

    BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS   290 ( 2 )   701 - 706   2002年1月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1006/bbrc.2001.6258

    Web of Science

    researchmap

  • Placentomegaly in cloned mouse concepti caused by expansion of the spongiotrophoblast layer 査読 国際誌

    Biol. Reprod   Vol.65 ( No.6 )   1813 - 1821   2001年12月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    Web of Science

    researchmap

  • CpG island of rat sphingosine kinase-1 gene: tissue-dependent DNA methylation status and multiple alternative first exons 査読

    T Imamura, J Ohgane, S Ito, T Ogawa, N Hattori, S Tanaka, K Shiota

    GENOMICS   76 ( 1-3 )   117 - 125   2001年8月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1006/geno.2001.6607

    Web of Science

    researchmap

  • DNA methylation regulates placental lactogen I gene expression 査読

    JH Cho, H Kimura, T Minami, J Ohgane, N Hattori, S Tanaka, K Shiota

    ENDOCRINOLOGY   142 ( 8 )   3389 - 3396   2001年8月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1210/en.142.8.3389

    Web of Science

    researchmap

  • Retinoic acid promotes differentiation of trophoblast stem cells to a giant cell fate 査読 国際誌

    Dev. Biol   Vol.235 ( No.2 )   422 - 432   2001年7月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1006/dbio.2001.0300

    Web of Science

    researchmap

  • DNA methylation variation in cloned mice 査読

    J Ohgane, T Wakayama, Y Kogo, S Senda, N Hattori, S Tanaka, R Yanagimachi, K Shiota

    GENESIS   30 ( 2 )   45 - 50   2001年6月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1002/gene.1031

    Web of Science

    researchmap

  • Analysis of CpG islands of trophoblast giant cells by restriction landmark genomic scanning 査読

    J Ohgane, JI Aikawa, A Ogura, N Hattori, T Ogawa, K Shiota

    DEVELOPMENTAL GENETICS   22 ( 2 )   132 - 140   1998年

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1002/(SICI)1520-6408(1998)22:2<132::AID-DVG3>3.0.CO;2-7

    Web of Science

    researchmap

  • Molecular cloning of rat leukemia inhibitory factor receptor alpha-chain gene and its expression during pregnancy 査読 国際誌

    Biochim. Biophys. Acta   Vol.1353 ( No.3 )   266 - 276   1997年9月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    Web of Science

    researchmap

  • Nutritional regulation of gene expression of insulin-like growth factor-binding proteins and the acid-labile subunit in various tissues of rats 査読

    A Takenaka, M Mori, S Yamada, J Ohgane, SI Takahashi, T Noguchi

    JOURNAL OF ENDOCRINOLOGY   150 ( 1 )   33 - 41   1996年7月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    Web of Science

    researchmap

▼全件表示

書籍等出版物

  • 「組織特異的メチル化と体細胞核移植クローン」 『エピジェネティクス』

    編者:佐々木裕之 共著者:大鐘潤,ほか2名（ 担当： 共著）

    シュプリンガー東京  2004年4月 

    　詳細を見る

    担当ページ：147-156   記述言語：日本語   著書種別：学術書

    researchmap

  • 「生殖とエピジェネティクス –胎盤栄養膜細胞ゲノムDNAの組織特異的メチル化」 『生殖ジェネティクス』

    鈴木秋悦,塩田邦郎（ 担当： 共著）

    メジカルビュー社  1999年11月 

    　詳細を見る

    担当ページ：34-42   記述言語：日本語   著書種別：学術書

    researchmap

MISC

  • エピジェネティクス

    服部奈緒子, 大鐘潤, 塩田邦郎

    化学と生物   44   841 - 850   2006年

    　詳細を見る

  • 組織特異的DNAメチル化と体細胞核移植クローニング

    大鐘潤, 小田真由美, 塩田邦郎

    エピジェネティックス、シュプリンガーフェアラーク東京   147 - 1154   2004年

    　詳細を見る

  • Effect of benzo(a)pyrene on placentation.

    J Tomikawa, JL Yan, J Ohgane, N Hattori, T Makino, S Tanaka, K Shiota

    BIOLOGY OF REPRODUCTION   66   199 - 199   2002年

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）  

    Web of Science

    researchmap

  • Mouse trophoblast cells are resistant to AhR ligand

    J Tomikawa, JL Yan, J Ohgane, N Hattori, S Tanaka, K Shiota

    MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL   12   504A - 504A   2001年11月

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）  

    Web of Science

    researchmap

  • Placentomegaly in cloned mice caused by expansion of spongiotrophoblast layer.

    S Tanaka, M Oda, Y Toyoshima, T Wakayama, M Tanaka, N Yoshida, N Hattori, J Ohgane, R Yanagimachi, K Shiota

    BIOLOGY OF REPRODUCTION   64   171 - 171   2001年

    　詳細を見る

    記述言語：英語   掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）  

    Web of Science

    researchmap

  • 生殖とエピジェネティックス、胎盤栄養膜細胞ゲノムDNAの組織特異的メチル化

    大鐘潤, 塩田邦郎

    Modern Reproductive Medicine、生殖とGenetics   3   34 - 42   1999年

    　詳細を見る

▼全件表示

共同研究・競争的資金等の研究課題

  • 我が国初のヒトへの移植用ブタの作出とヒトへの適合性を評価するシステム構築

    研究課題/領域番号：24K02513  2024年4月 - 2027年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

    長屋 昌樹, 渡邊 將人, 大鐘 潤, 長嶋 比呂志, 宮川 周士

    　 詳細を見る

    配分額：18590000円 （ 直接経費：14300000円 、 間接経費：4290000円 ）

    researchmap

  • ハプロ不全優性遺伝病発症・重篤化の根幹となるエピジェネティックなゆらぎ

    研究課題/領域番号：21H04755  2021年4月 - 2024年3月

    日本学術振興会  基板研究(A)  基盤研究(A)

    大鐘 潤, 乾 雅史, 長嶋 比呂志

    　 詳細を見る

    担当区分：研究代表者 

    配分額：51840000円 （ 直接経費：42120000円 、 間接経費：9720000円 ）

    FBN1遺伝子座についてブタ型CpGショア正常アリルおよびマウス欠損アリルをヘテロ接合性に保持するマウスの作製について、ES細胞樹立を行い、今後は個体を作製する予定である。また、FBN1 のプロモーターアッセイにより、DNAメチル化のゆらぎを示すCpG ショアは近位エンハンサーとして機能することが明らかになった。さらにCpGアイランド、CpGショアのプロモータ活性は、DNAメチル化によって抑制されることも見出した。RUNX2については、軟骨細胞に分化誘導可能な幹細胞にDNA高メチル化誘導のエピゲノム編集ベクターを導入し、Runx2プロモーターでの高メチル化誘導が可能なことを証明した。

    researchmap

  • 常染色体優性遺伝病モデル遺伝子改変ブタにおける病態発症機構の解明と表現型制御

    研究課題/領域番号：15H02480  2015年4月 - 2019年3月

    日本学術振興会  基盤研究（A）  基盤研究(A)

    長嶋 比呂志, 大鐘 潤

    　 詳細を見る

    担当区分：研究分担者 

    我々は常染色体優性遺伝病であるマルファン症候群（MFS）モデルブタを、責任遺伝子であるFibrillin1（FBN1）に変異(Glu433AsnfsX98)を導入して作出した。続いて、ブタFBN1プロモーター領域を解析し、FBN1 CpG shoreに一塩基多型（SNP）を有するブタの系統を見つけ出した。雌性MFSブタと雄性SNPブタの後代産仔（F1）を作出し、FBN1 CpG shoreのメチル化状態とFBN1の発現量の関係を調べる事が可能な個体を樹立した。解析の結果、遺伝子発現の低下を伴うハプロ不全病の発症にエピジェネティクスが関与する事を示唆する結果が得られた。

    researchmap

  • エピジェネティック活性をもつ化学物質の影響把握と新たな環境リスクの予防策

    研究課題/領域番号：15H01749  2015年4月 - 2019年3月

    日本学術振興会  基盤研究（A）  基盤研究(A)

    福田 秀子, 伊藤 智彦, 桂 真理, 藤渕 航, 大鐘 潤, 中尾 洋一, 阿部 訓也, 南齋 ひろ子, 近藤 昌代, 鈴木 伸之介, 大塚 悟史

    　 詳細を見る

    担当区分：研究分担者 

    多能性幹細胞ヒトiPS細胞を用いて、DNA及びヒストンメチル化修飾を指標としたエピジェネティック状態を可視的に検出する方法を開発した。135種の化学物質を解析し、エピジェネティック毒性の検出を行った。低線量放射線の照射によるヒトiPS細胞の網膜神経節細胞への分化に対する影響を調べた。疾患原因遺伝子のプロモーター領域でのDNAメチル化変動を特異的DNA配列の解析により詳細に調べた。分化度の違いによるエピジェネティック状態の差を検出できる手法も開発した。これらの結果は、多能性幹細胞を用いたエピジェネティック活性の迅速な検出により、化学物質や環境要因の初期イベントを把握し後発の影響予測に活用できる。

    researchmap

  • エピゲノム改変を基点としたブタ有用形質発現とヒト生活習慣病病態の総合理解

    2013年4月 - 2015年3月

    基盤研究 (C) 

    　 詳細を見る

    担当区分：研究代表者 

    researchmap

  • 機能性非コードRNAによるエピゲノム改変を利用した有用細胞および病態モデル動物の作出

    2013年4月 - 2015年3月

    　 詳細を見る

    担当区分：研究代表者 

    researchmap

  • 内在性非コードRNAを考慮した機能性RNAによるエピゲノム改変最適化の試み

    研究課題/領域番号：22710181  2010年4月 - 2012年3月

    日本学術振興会  若手研究 (B)  若手研究(B)

    大鐘 潤

    　 詳細を見る

    担当区分：研究代表者 

    近年、内在性、外来など様々な機能性の非コード(nc) RNAが標的遺伝子のエピジェネティック制御に関与する事が報告され始めた。内在性ncRNAは細胞種特異的発現を示すものも多く、機能性ncRNAの細胞への導入によるエピジェネティック改変(発現制御)の効率化には、内在性ncRNAの標的遺伝子同定と発現状態との総合理解が必須である。昨年度の解析から、ES細胞でncRNA生成に関わる酵素の欠損により、DNAメチル化状態が変化する遺伝子を多数同定した。ES細胞の多能性維持に重要なSall4遺伝子は、プロモーター領域に長い一本鎖アンチセンスncRNA(ASncRNA)が存在し、このASncRNAによりDicer非依存的にDNAメチル化制御を受けることが判明した。そこで今年度は、Sall4遺伝子のプロモーター領域に存在するASncRNAに注目し、機能解析を行った。マウス繊維芽細胞では、Sall4はプロモーター領域が高メチル化で発現が見られないが、Sall4 ASncRNAを一過的に強制発現させることで、プロモーター領域の脱メチル化を誘導できた。一方、内在性Sall4 ASncRNAの機能を解析するために、ES細胞でASncRNAを標的とするshRNAを導入することでノックダウンしたところ、本来低メチル化のSall4プロモーターがメチル化され、Sall4遺伝子の発現も減少し、ES細胞の自己再生にも影響を与えることが確認された。本研究により、内在性Sall4 ASncRNAは、オーバーラップする標的領域の低メチル化状態を維持し、遺伝子の活性化に重要であることが示された。また、卵特異的ヒストンや環境中に残存する化学物質とエピジェネティクス制御についてもSall4遺伝子を中心に明らかにした。本研究により、ncRNAによりDNAメチル化状態が維持される遺伝子を多数同定できたことから、今後は内在性ncRNAの強制発現やノックダウンにより標的遺伝子のDNAメチル化状態の改変(エピゲノム改変)を基盤として、有用細胞や病態モデル動物を作製するための新技術の確立につながると考えられる。

    researchmap

  • 性差のエピゲノム解析

    研究課題/領域番号：21221008  2009年5月 - 2014年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(S)

    塩田 邦郎, 八木 慎太郎, 大鐘 潤, 中山 裕之, 種村 健太郎, 山内 啓太郎, 田中 智, 菊水 健史, 山内 啓太郎, 八木 慎太郎, 種村 健太郎, 廣澤 瑞子

    　 詳細を見る

    配分額：208390000円 （ 直接経費：160300000円 、 間接経費：48090000円 ）

    哺乳類の雌雄の違いは性染色体(X、Y)によると考えられてきたが、発達や様々な病気を雌雄の違いで考えると性染色体のみでは説明が困難である。雌雄で同じ常染色体でもゲノムDNAの利用法に違いはないだろうか？本研究では、DNAメチル化解析やヒストン修飾解析を行い、常染色体のゲノムの長期利用に性差を示す領域が存在することを明らかにした。雌雄はゲノム配列が同じ常染色体であっても、性依存性にゲノムの利用を変えている。

    researchmap

  • ES細胞から栄養膜幹細胞へのエピジェネティック制御

    研究課題/領域番号：21248039  2009年4月 - 2011年3月

    日本学術振興会  基盤研究 (A)  基盤研究(A)

    田中 智, 大鐘 潤, 塩田 邦郎, 古江 美保

    　 詳細を見る

    担当区分：研究分担者 

    胚性幹(ES)細胞から栄養膜細胞への分化転換に伴うエピゲノムの形成機序を解析するために、BMP4処理による分化転換における遺伝子発現動態の解析を行い、また、そこからの栄養膜幹(TS)細胞株の樹立を目指した。分化転換過程にはTS様細胞が存在することを明らかにしたが、得られた新規細胞株はむしろ胚体外胚葉由来幹細胞(EpiSC)に似た性質を有した。すなわち、本条件下での分化転換過程には、EpiSC様細胞とTS様細胞の両者が混在することが示唆される。

    researchmap

  • マウス初期胚発生におけるエピゲノム形成と細胞分化

    研究課題/領域番号：20062003  2008年4月 - 2012年3月

    日本学術振興会  特定領域研究  特定領域研究

    田中 智, 大鐘 潤, 塩田 邦郎

    　 詳細を見る

    担当区分：研究分担者 

    マウス初期胚由来胚性幹細胞(ES細胞)および栄養膜幹細胞(TS細胞)と体細胞組織の比較により、それぞれの幹細胞に特徴的なDNAメチル化状態を示すゲノム領域を同定した。得られたDNAメチル化情報などに基づき、核移植クローン胚由来TS細胞は正常胚由来TS細胞と同等であることを示した。また、初期胚発生において、DNAメチル化プロフィールは形態的な細胞分化のあとで形成されることを明らかにした。

    researchmap

  • 生研センター 新技術・新分野創出のための基礎研究推進事業 「DNAメチル化情報の解析による動物ゲノムの高度利用」分担研究者

    1999年4月 - 2003年3月

    　 詳細を見る

    担当区分：研究分担者  資金種別：競争的資金

    researchmap

  • 学術振興会特別研究員（DC2-PD）「胎盤ゲノムCpGアイランドの解析：細胞分化とクローン動物の分子基盤」研究代表者

    研究課題/領域番号：98J04734  1998年4月 - 1999年7月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  特別研究員奨励費

    大鐘 潤

    　 詳細を見る

    担当区分：研究代表者  資金種別：競争的資金

    researchmap

▼全件表示